Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SNRPBP14678 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms