Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 CCDC152-202ENST00000388827 1237 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB1P14653 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms