Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSMBP08118 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSMBP08118 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MSMBP08118 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MSMBP08118 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSMBP08118 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MSMBP08118 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSMBP08118 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSMBP08118 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSMBP08118 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSMBP08118 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MSMBP08118 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSMBP08118 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MSMBP08118 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSMBP08118 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSMBP08118 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSMBP08118 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSMBP08118 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSMBP08118 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSMBP08118 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSMBP08118 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSMBP08118 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMBP08118 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMBP08118 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMBP08118 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMBP08118 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMBP08118 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMBP08118 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMBP08118 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMBP08118 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMBP08118 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMBP08118 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMBP08118 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMBP08118 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMBP08118 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMBP08118 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMBP08118 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMBP08118 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMBP08118 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMBP08118 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMBP08118 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMBP08118 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMBP08118 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMBP08118 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMBP08118 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMBP08118 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMBP08118 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMBP08118 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMBP08118 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMBP08118 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMBP08118 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMBP08118 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMBP08118 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMBP08118 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMBP08118 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMBP08118 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMBP08118 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMBP08118 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMBP08118 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMBP08118 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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