Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTMAP06454 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTMAP06454 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTMAP06454 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTMAP06454 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTMAP06454 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTMAP06454 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTMAP06454 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTMAP06454 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTMAP06454 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTMAP06454 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTMAP06454 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTMAP06454 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTMAP06454 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTMAP06454 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTMAP06454 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTMAP06454 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTMAP06454 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTMAP06454 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTMAP06454 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTMAP06454 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTMAP06454 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTMAP06454 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTMAP06454 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PTMAP06454 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PTMAP06454 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTMAP06454 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTMAP06454 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTMAP06454 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTMAP06454 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTMAP06454 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTMAP06454 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTMAP06454 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTMAP06454 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTMAP06454 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTMAP06454 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTMAP06454 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTMAP06454 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTMAP06454 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTMAP06454 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTMAP06454 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTMAP06454 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTMAP06454 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTMAP06454 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTMAP06454 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTMAP06454 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTMAP06454 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTMAP06454 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTMAP06454 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTMAP06454 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTMAP06454 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTMAP06454 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTMAP06454 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTMAP06454 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTMAP06454 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTMAP06454 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTMAP06454 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTMAP06454 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTMAP06454 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTMAP06454 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTMAP06454 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTMAP06454 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTMAP06454 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTMAP06454 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTMAP06454 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTMAP06454 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTMAP06454 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTMAP06454 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTMAP06454 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTMAP06454 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTMAP06454 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTMAP06454 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTMAP06454 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTMAP06454 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTMAP06454 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTMAP06454 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTMAP06454 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTMAP06454 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTMAP06454 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTMAP06454 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTMAP06454 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTMAP06454 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTMAP06454 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTMAP06454 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTMAP06454 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTMAP06454 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTMAP06454 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTMAP06454 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTMAP06454 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTMAP06454 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTMAP06454 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTMAP06454 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTMAP06454 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTMAP06454 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTMAP06454 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTMAP06454 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTMAP06454 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTMAP06454 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTMAP06454 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTMAP06454 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms