Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CRXO43186 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CRXO43186 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CRXO43186 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CRXO43186 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CRXO43186 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CRXO43186 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CRXO43186 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CRXO43186 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CRXO43186 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CRXO43186 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CRXO43186 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CRXO43186 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CRXO43186 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CRXO43186 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CRXO43186 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CRXO43186 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CRXO43186 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CRXO43186 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CRXO43186 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CRXO43186 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CRXO43186 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CRXO43186 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CRXO43186 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CRXO43186 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CRXO43186 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms