Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBDO15205 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBDO15205 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBDO15205 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBDO15205 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBDO15205 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBDO15205 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBDO15205 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBDO15205 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBDO15205 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBDO15205 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBDO15205 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
UBDO15205 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBDO15205 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBDO15205 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBDO15205 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBDO15205 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBDO15205 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBDO15205 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBDO15205 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBDO15205 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBDO15205 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBDO15205 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBDO15205 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBDO15205 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBDO15205 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBDO15205 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBDO15205 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBDO15205 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBDO15205 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBDO15205 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBDO15205 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBDO15205 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBDO15205 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UBDO15205 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBDO15205 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBDO15205 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBDO15205 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBDO15205 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBDO15205 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBDO15205 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBDO15205 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBDO15205 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBDO15205 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBDO15205 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBDO15205 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBDO15205 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBDO15205 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBDO15205 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBDO15205 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBDO15205 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBDO15205 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBDO15205 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBDO15205 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBDO15205 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBDO15205 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBDO15205 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBDO15205 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBDO15205 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBDO15205 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBDO15205 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBDO15205 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBDO15205 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
UBDO15205 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
UBDO15205 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBDO15205 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBDO15205 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBDO15205 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBDO15205 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBDO15205 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBDO15205 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBDO15205 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBDO15205 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBDO15205 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBDO15205 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms