Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms