Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC2Q9Y235 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms