Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN8Q9UBY8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms