Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E8

MARCH4, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH4Q9P2E8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MARCH4Q9P2E8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MARCH4Q9P2E8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MARCH4Q9P2E8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MARCH4Q9P2E8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MARCH4Q9P2E8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MARCH4Q9P2E8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MARCH4Q9P2E8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MARCH4Q9P2E8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MARCH4Q9P2E8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MARCH4Q9P2E8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MARCH4Q9P2E8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms