Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms