Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms