Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR31

SAR1A, GTP-binding protein SAR1a, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1AQ9NR31 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SAR1AQ9NR31 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms