Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms