Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNG6Q9BXT2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms