Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms