Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTA3Q9BTC8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MTA3Q9BTC8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MTA3Q9BTC8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MTA3Q9BTC8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTA3Q9BTC8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTA3Q9BTC8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTA3Q9BTC8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTA3Q9BTC8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTA3Q9BTC8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTA3Q9BTC8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTA3Q9BTC8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTA3Q9BTC8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTA3Q9BTC8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTA3Q9BTC8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTA3Q9BTC8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTA3Q9BTC8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTA3Q9BTC8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTA3Q9BTC8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTA3Q9BTC8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTA3Q9BTC8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTA3Q9BTC8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTA3Q9BTC8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTA3Q9BTC8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTA3Q9BTC8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTA3Q9BTC8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTA3Q9BTC8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms