Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms