Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
POP1Q99575 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP1Q99575 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP1Q99575 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP1Q99575 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP1Q99575 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP1Q99575 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP1Q99575 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP1Q99575 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP1Q99575 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP1Q99575 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP1Q99575 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP1Q99575 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP1Q99575 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POP1Q99575 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POP1Q99575 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POP1Q99575 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POP1Q99575 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
POP1Q99575 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POP1Q99575 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POP1Q99575 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POP1Q99575 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POP1Q99575 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POP1Q99575 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POP1Q99575 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POP1Q99575 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POP1Q99575 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POP1Q99575 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POP1Q99575 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POP1Q99575 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
POP1Q99575 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POP1Q99575 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POP1Q99575 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
POP1Q99575 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POP1Q99575 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POP1Q99575 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POP1Q99575 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POP1Q99575 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
POP1Q99575 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POP1Q99575 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POP1Q99575 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POP1Q99575 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POP1Q99575 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POP1Q99575 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POP1Q99575 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POP1Q99575 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POP1Q99575 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POP1Q99575 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POP1Q99575 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POP1Q99575 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POP1Q99575 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POP1Q99575 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POP1Q99575 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POP1Q99575 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
POP1Q99575 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POP1Q99575 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POP1Q99575 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
POP1Q99575 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POP1Q99575 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POP1Q99575 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POP1Q99575 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POP1Q99575 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POP1Q99575 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POP1Q99575 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POP1Q99575 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POP1Q99575 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP1Q99575 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP1Q99575 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP1Q99575 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP1Q99575 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP1Q99575 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP1Q99575 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP1Q99575 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP1Q99575 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP1Q99575 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP1Q99575 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP1Q99575 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP1Q99575 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP1Q99575 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP1Q99575 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP1Q99575 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP1Q99575 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP1Q99575 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP1Q99575 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP1Q99575 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP1Q99575 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
POP1Q99575 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP1Q99575 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP1Q99575 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP1Q99575 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP1Q99575 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POP1Q99575 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POP1Q99575 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POP1Q99575 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POP1Q99575 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POP1Q99575 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POP1Q99575 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POP1Q99575 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POP1Q99575 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POP1Q99575 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms