Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms