Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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