Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
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