Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms