Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HLA-CQ95604 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms