Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYK1

CNTNAP5, Contactin-associated protein-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP5Q8WYK1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTNAP5Q8WYK1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms