Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC47Q8N1G4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC47Q8N1G4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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