Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMCO3Q6UWJ1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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