Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UFSP1Q6NVU6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms