Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms