Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms