Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf46Q504U0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms