Protein–RNA interactions for Protein: Q499Z3

SLFNL1, Schlafen-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFNL1Q499Z3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLFNL1Q499Z3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLFNL1Q499Z3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFNL1Q499Z3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFNL1Q499Z3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFNL1Q499Z3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFNL1Q499Z3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFNL1Q499Z3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFNL1Q499Z3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFNL1Q499Z3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFNL1Q499Z3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFNL1Q499Z3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFNL1Q499Z3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFNL1Q499Z3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFNL1Q499Z3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFNL1Q499Z3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFNL1Q499Z3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFNL1Q499Z3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFNL1Q499Z3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFNL1Q499Z3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFNL1Q499Z3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFNL1Q499Z3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFNL1Q499Z3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms