Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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