Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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