Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC18A3Q16572 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC18A3Q16572 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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