Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 P4HB-217ENST00000573778 688 ntTSL 522.15■■□□□ 1.142e-7■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.113e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.093e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.083e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 EML2-205ENST00000586195 1952 ntTSL 221.78■■□□□ 1.083e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 12e-7■■□□□ 12.1
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PCBP1Q15365 MARS-223ENST00000551431 559 ntTSL 421.26■□□□□ 0.992e-7■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 P4HB-221ENST00000576052 562 ntTSL 421.11■□□□□ 0.972e-7■■□□□ 12.1
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PCBP1Q15365 EML2-202ENST00000399594 2232 ntTSL 220.96■□□□□ 0.953e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.943e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 MARS-202ENST00000447721 1328 ntTSL 220.87■□□□□ 0.932e-7■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.893e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 BAG6-257ENST00000462875 972 ntTSL 220.17■□□□□ 0.823e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.763e-6■■□□□ 12.1
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PCBP1Q15365 CSNK1D-214ENST00000580565 566 ntTSL 419.49■□□□□ 0.713e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.693e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 DGCR8-204ENST00000457069 770 ntTSL 319.26■□□□□ 0.673e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.653e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.623e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 CSNK1D-205ENST00000403276 1040 ntTSL 218.6■□□□□ 0.573e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 EML2-225ENST00000590819 626 ntTSL 317.86■□□□□ 0.453e-6■■□□□ 12.1
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PCBP1Q15365 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.394e-7■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 RGL2-239ENST00000460988 754 ntTSL 317.37■□□□□ 0.379e-9■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 MARS-213ENST00000548674 749 ntTSL 517.19■□□□□ 0.342e-7■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.344e-7■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 HNRNPF-205ENST00000477108 636 ntTSL 1 (best)17.11■□□□□ 0.332e-7■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 DGCR8-205ENST00000475941 2669 ntTSL 216.92■□□□□ 0.33e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.252e-7■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.243e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.244e-7■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.213e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.22e-7■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 NBPF11-203ENST00000614506 5152 ntTSL 1 (best)16.26■□□□□ 0.193e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.152e-7■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.13e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 P4HB-218ENST00000574007 1053 ntTSL 215.5■□□□□ 0.072e-7■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 CSNK1D-208ENST00000578501 1124 ntTSL 215.18■□□□□ 0.023e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 MARS-204ENST00000545888 2979 ntTSL 514.67□□□□□ -0.062e-7■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 CSNK1D-217ENST00000581241 6094 ntTSL 214.5□□□□□ -0.093e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.113e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.143e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.163e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.172e-7■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 EML2-214ENST00000588272 361 ntTSL 313.79□□□□□ -0.23e-6■■□□□ 12.1
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PCBP1Q15365 CSNK1D-222ENST00000584377 2891 ntTSL 213.65□□□□□ -0.223e-6■■□□□ 12.1
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PCBP1Q15365 HNRNPF-207ENST00000544000 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.322e-7■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 MARS-203ENST00000537638 3592 ntTSL 213.03□□□□□ -0.322e-7■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 UROD-212ENST00000472254 934 ntTSL 212.83□□□□□ -0.363e-6■■□□□ 12.1
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PCBP1Q15365 CALM3-207ENST00000595072 721 ntTSL 212.72□□□□□ -0.373e-6■■□□□ 12.1
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PCBP1Q15365 FOXJ3-201ENST00000361346 5225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.443e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 FOXJ3-202ENST00000361776 5106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.473e-6■■□□□ 12.1
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PCBP1Q15365 HNRNPF-203ENST00000357065 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.632e-7■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 GNL1-204ENST00000464231 545 ntTSL 1 (best)10.97□□□□□ -0.653e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 API5-201ENST00000378852 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.713e-6■■□□□ 12.1
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PCBP1Q15365 PABPC1-213ENST00000519848 676 ntTSL 29.5□□□□□ -0.891e-17■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 GNL1-203ENST00000462708 774 ntTSL 29.27□□□□□ -0.933e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 CDK16-205ENST00000462483 527 ntTSL 29.09□□□□□ -0.953e-14■■□□□ 12.1
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PCBP1Q15365 FOXJ3-205ENST00000372573 5309 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.083e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 AC087380.1-201ENST00000420465 1001 ntTSL 38.26□□□□□ -1.093e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 SMAP2-203ENST00000435168 666 ntTSL 57.2□□□□□ -1.263e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.263e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 PABPC1-216ENST00000520868 971 ntTSL 56.98□□□□□ -1.291e-17■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 PABPC1-204ENST00000517990 487 ntTSL 56.93□□□□□ -1.31e-17■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 PABPC1-220ENST00000522658 736 ntTSL 26.92□□□□□ -1.31e-17■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.313e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 AC087380.1-203ENST00000420726 752 ntTSL 56.59□□□□□ -1.353e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.682e-8■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 NUDT4-207ENST00000550056 531 ntTSL 417.68■□□□□ 0.422e-8■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.132e-8■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 NUDT4-204ENST00000547014 1419 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.572e-8■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 NUDT4-205ENST00000548662 765 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.872e-8■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 NUDT4-206ENST00000549992 3607 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.082e-8■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 NOP58-208ENST00000488403 871 ntTSL 216.25■□□□□ 0.193e-15■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 NOP58-202ENST00000426814 655 ntTSL 216.04■□□□□ 0.163e-15■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 NOP58-205ENST00000472050 582 ntTSL 312.58□□□□□ -0.43e-15■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 NOP58-204ENST00000467734 638 ntTSL 512.35□□□□□ -0.433e-15■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 NOP58-209ENST00000492688 571 ntTSL 45.99□□□□□ -1.453e-15■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 CTSB-233ENST00000534636 633 ntTSL 420.59■□□□□ 0.892e-7■■□□□ 12
PCBP1Q15365 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.332e-7■■□□□ 12
PCBP1Q15365 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.994e-6■■□□□ 12
PCBP1Q15365 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.994e-6■■□□□ 12
PCBP1Q15365 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.994e-6■■□□□ 12
PCBP1Q15365 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.594e-6■■□□□ 12
PCBP1Q15365 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.894e-6■■□□□ 12
PCBP1Q15365 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.864e-6■■□□□ 12
PCBP1Q15365 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.624e-6■■□□□ 12
PCBP1Q15365 MED25-207ENST00000595185 760 ntTSL 1 (best)16.52■□□□□ 0.244e-6■■□□□ 12
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