Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
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