Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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