Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms