Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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