Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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