Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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SP140Q13342 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP140Q13342 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP140Q13342 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP140Q13342 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP140Q13342 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP140Q13342 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP140Q13342 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP140Q13342 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP140Q13342 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP140Q13342 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP140Q13342 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SP140Q13342 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SP140Q13342 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SP140Q13342 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SP140Q13342 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SP140Q13342 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SP140Q13342 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SP140Q13342 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SP140Q13342 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SP140Q13342 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SP140Q13342 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SP140Q13342 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SP140Q13342 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SP140Q13342 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SP140Q13342 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SP140Q13342 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SP140Q13342 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
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SP140Q13342 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SP140Q13342 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SP140Q13342 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
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SP140Q13342 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SP140Q13342 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SP140Q13342 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SP140Q13342 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SP140Q13342 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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SP140Q13342 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SP140Q13342 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SP140Q13342 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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SP140Q13342 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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SP140Q13342 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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SP140Q13342 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SP140Q13342 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SP140Q13342 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SP140Q13342 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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SP140Q13342 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SP140Q13342 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SP140Q13342 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SP140Q13342 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SP140Q13342 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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