Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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SEMA3FQ13275 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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SEMA3FQ13275 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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SEMA3FQ13275 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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SEMA3FQ13275 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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SEMA3FQ13275 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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SEMA3FQ13275 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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SEMA3FQ13275 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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SEMA3FQ13275 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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SEMA3FQ13275 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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SEMA3FQ13275 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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SEMA3FQ13275 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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SEMA3FQ13275 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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SEMA3FQ13275 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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SEMA3FQ13275 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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SEMA3FQ13275 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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SEMA3FQ13275 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
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