Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms