Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VLDLRP98155 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms