Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms