Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA1P46926 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA1P46926 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA1P46926 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA1P46926 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA1P46926 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA1P46926 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA1P46926 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA1P46926 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA1P46926 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA1P46926 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA1P46926 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA1P46926 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA1P46926 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA1P46926 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA1P46926 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA1P46926 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA1P46926 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA1P46926 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA1P46926 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA1P46926 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA1P46926 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA1P46926 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA1P46926 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA1P46926 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA1P46926 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA1P46926 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA1P46926 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA1P46926 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA1P46926 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA1P46926 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA1P46926 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNPDA1P46926 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms