Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FLT4P35916 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FLT4P35916 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FLT4P35916 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FLT4P35916 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FLT4P35916 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FLT4P35916 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FLT4P35916 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FLT4P35916 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FLT4P35916 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FLT4P35916 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FLT4P35916 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FLT4P35916 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FLT4P35916 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FLT4P35916 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FLT4P35916 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FLT4P35916 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FLT4P35916 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FLT4P35916 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FLT4P35916 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FLT4P35916 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FLT4P35916 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FLT4P35916 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FLT4P35916 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
FLT4P35916 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FLT4P35916 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FLT4P35916 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FLT4P35916 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FLT4P35916 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FLT4P35916 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FLT4P35916 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FLT4P35916 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FLT4P35916 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FLT4P35916 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FLT4P35916 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FLT4P35916 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FLT4P35916 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FLT4P35916 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FLT4P35916 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FLT4P35916 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FLT4P35916 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FLT4P35916 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FLT4P35916 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FLT4P35916 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FLT4P35916 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FLT4P35916 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FLT4P35916 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FLT4P35916 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FLT4P35916 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FLT4P35916 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FLT4P35916 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FLT4P35916 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FLT4P35916 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FLT4P35916 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FLT4P35916 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FLT4P35916 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FLT4P35916 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FLT4P35916 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FLT4P35916 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FLT4P35916 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FLT4P35916 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FLT4P35916 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FLT4P35916 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FLT4P35916 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FLT4P35916 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FLT4P35916 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FLT4P35916 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FLT4P35916 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FLT4P35916 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FLT4P35916 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FLT4P35916 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FLT4P35916 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FLT4P35916 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FLT4P35916 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FLT4P35916 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FLT4P35916 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FLT4P35916 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FLT4P35916 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FLT4P35916 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FLT4P35916 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FLT4P35916 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FLT4P35916 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FLT4P35916 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FLT4P35916 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FLT4P35916 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FLT4P35916 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FLT4P35916 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FLT4P35916 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FLT4P35916 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FLT4P35916 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FLT4P35916 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FLT4P35916 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FLT4P35916 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FLT4P35916 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FLT4P35916 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FLT4P35916 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FLT4P35916 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FLT4P35916 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FLT4P35916 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FLT4P35916 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms