Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA13P31271 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms