Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms